以下根据签证的类型分别介绍手续和所需提交的材料。各个材料的有效期均在发行后3个月以内（材料上如果有有效期，则应在有效期内提交）。另外，若无专门提示，签证手续均须通过代办机构办理。
持在留资格认定证明书时的签证申请手续
办理短期商务、探亲、访友签证之外的赴日签证，首先需由日本国内的邀请人（单位）在法务省入国管理局为签证申请人办理相关的“在留资格认定证明书”。
在留资格认定证明书自签发之日起有效期为3个月。签证申请人须在该证明书有效期内在所属日本驻华使领馆申办签证，并入境日本，逾期自动作废。申请需要通过使馆所指定的代办机构办理。
在留资格所需的材料
根据在留资格种类，申请签证时需要提交的材料也有所不同。
1.所有申请人需要提交的材料
（1）签证申请书（贝占附照片，2英寸白色背景，PDF格式）。
（2）护照。
（3）户口簿复印件（首页及申请人页）。
（4）暂住证或居住证明（限户籍非使馆管辖范围者）。
（5）在留资格认定证明书原件及复印件。
2.根据在留资格种类，除上述材料外，另需提交以下材料
在留资格种类
教授、艺术、宗教、报道、投资·经营、法律·会计、医疗、研究、教育、技术、人文·国际、企业内转勤、文化活动、特定活动
技能：雇用合同书及个人简历
兴行：
（1）合同书
（2）个人简历
（3）艺历证明材料
留学·就学：
（1）调查表
（2）学费支付者的在职证明
（3）毕业证明书（仅限留学）
研修：
（1）“研修派遣合同书”（只限通过派遣机构时，派遣机构和接收机构签订的文件）
（2）“合同书”（申请人和派遣机构签订的文件）
家族滞在：提问表
日本人配偶者、永住者配偶者、定住者：
婚姻经纬书（定住者签证申请，需提交调查表）
注：出于审查的需要，有时会要求申请人补充材料；如果申请人的户口所在地不在使馆管辖范围之内，须提交相关材料（暂住证或居留证明）以证明申请人在使馆管辖区内长期居住生活。
2.审查所需天数
签证申请材料的审查一般需要4个工作日，根据具体情况，有时可能会延长审查时间。
